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湛江中心人民医院关于拟采购湛江市临床医学研究所生物信息学分析平台高性能计算集群和一体化标准机房运维服务需求信息的发布湛中心医信息科【2024】44号

作者: 信息科 来源: 信息科 编辑: 袁欣 发布时间: 2024-12-03 点击数: 1447


一、项目一览表

项目名称

单位/数量

湛江市临床医学研究所生物信息学分析平台高性能计算集群和一体化标准机房运维服务

1项

二、项目背景:  
湛江市临床医学研究所生物信息学分析平台高性能计算集群和一体化标准机房于2021年投入使用,现机房相关设备的售后维保服务期满,需购买维保服务以保障系统的稳定运行,现拟采购高性能计算集群和机房一年的整体维保。

三、总系统需求说明: 
湛江市临床医学研究所生物信息学分析平台高性能计算集群和一体化标准机房需要的运维服务包含硬件设备和软件,具体清单如下:

硬件系统

登录/管理节点

Thinksystem SR650

CPU:2*Intel Xeon G4216 16C 100W 2.1GHz 处理器;
内存:4*32G ECC DDR4 2933,采用六通道配置;硬盘:2块600GB 10K磁盘;2x100GbE/EDR IB卡;

2

CPU计算单元

Thinksystem SD530

刀片机箱,冗余风扇电源:
2*Intel Xeon Gold 6230N 20C 125W 2.3GHz 处理器
内存:12*16G ECC DDR4 2933,采用六通道配置;硬盘:480GB企业级SSD盘;1块IB卡;

8

网络设备

Mellanox SB7890

36Port EDR 100Gb/s Infiniband智能交换机,配置足量线缆

1

G7025

48Port 1Gb千兆交换机,配置足量线缆

1

高性能存储

DSS-240

高性能存储包含656TB裸容量(配置满2PB时预计IO读写性能超过15GB/s),IB接口,并行文件系统

1

配套硬件

标准机柜

42U机柜,冗余PDU,

1

KVM

KVM和液晶显示套件

1

软件系统

集群管理软件

联想智能超算平台LiCO
  集群操作:WEB图形界面/并行命令/用户管理等
  健康监控:提供集群的健康状态监控
  作业调度:提供集群作业调度策略及管理:支持LSF/PBS/SLURM
  计费管理:提供对计费账户充值、扣款及汇率修改等管理功能
  系统部署:提供对集群系统软件的快速部署和自动配置

8

集群操作系统

CentOS 6.x

1

编译器及数学库&并行环境

Intel® Parallel Studio XE Cluster Edition for Linux, commercial edition
*Intel C/C++/Fortran,MKL,TBB,IPP、Advisor、Inspector、Vtune、MPI、Trace tool
OpenMPI, MPICH, MVAPICH/MVAPICH2等并行环境

1

系统服务

安装调试服务

硬件系统,集群软件系统,客户软件系统安装调试服务,确认硬件系统工作正常,网络通讯正常,确认软件正常工作,协助用户安装调试常用的CAE应用软件,并协助编写集成到作业调度系统的接口程序

1

售后支持服务

硬件保修服务,提供原厂上门保修服务,包括免费电话咨询、免费备件更换及免费现场支持服务,提供原厂商售后服务承诺函,3年7x24小时内上门保修服务、4小时内响应即售后技术支持服务;
软件技术支持,软件系统3年咨询服务,集群系统搭建、集成、性能调优等,协助用户安装调试编译主流应用软件;
提供三年集群维护服务,每季度巡检、原厂相关专家现场交流

1

技术培训

原厂相关专家≥1天关于系统安装配置、系统调试、操作使用、运行维护、故障排除等硬件方面知识的培训;
原厂相关专家≥2天关于软件:软件结构、调度软件、集群软件、并行文件系统,系统日常维护、操作、流程、定制开发及升级等软件方面知识的培训;系统总价

1

系统外围设备

编号

产品名称

规格型号

数量

单位

备注

机房装饰

铝扣天花

600mm*600mm

16

m2

含安装配件

防静电地板

600mm*600mm*35mm、无边

16

m2

预留5-7个标准机柜空间,以备未来扩容

UPS电源系统

UPS 电源

3C3 PRO-60KS

1

三进三出/60KVA

电池

100Ah/12V

64

后备30-60分钟

机柜式电池柜

订制

2

 

电池开关箱

施耐德250A开关

1

 

电池开关及连接线

RV70mm2电缆

1

 

机柜及桥架系统

网格桥架(强电用)

200mm*50mm

18

含安装配件

网格桥架(网络用)

300mm*50mm

16

含安装配件

配电系统

精密配电列头柜

300*1100*20000mm

1

UPS输入、输出开关及维修旁路开关、分路输出开关、空调开关、防雷器等(采用施耐德开关)

电缆

ZR-YJV4*70mm2+1*35mm2

30

总市电输入

电缆

ZR-YJV4*35mm2+1*25mm2

10

UPS输入、输出电缆

电缆

ZR-YJV4*16mm2+1*10mm2

30

精密空调电缆

分路电缆

ZR-RVV3*6mm2

100

每机柜两路

分路电缆

ZR-RVV3*4mm2

50

每机柜两路

分路电缆

ZR-BV2.5mm2

300

灯、插座

LED格栅灯盘

3*11W

10

600*600mm

灯开关面板

双联单控

2

 

插座

二三插

7

 

IEC309防脱扣插座

220V/32A

22

每机柜两个

IEC309防脱扣插座

220V/16A

4

每机柜两个

其它施工配件

 

1

 

空调系统

精密空调

25KW

2

变频恒温恒湿精密空调、25KW、300*1100*20000mm、水平送风,要求国际一线品牌

精密空调安装

 

2

单程20米铜管、保温、电源线、机座等

消防系统

气体消防系统

柜式七氟丙烷自动灭火系统

1

 

四、服务要求: 
具体维保需求如下:
1、硬件保修服务:提供高性能计算集群(含登录/管理节点、计算节点、存储节点以及网络设备等)和机房(含供配电系统、照明系统、UPS、精密空调、新/排风系统、动力环境监控系统、门禁安保系统、消防系统等)硬件设备1年7x24小时原厂或不低于原厂服务质量的上门保修服务,包括免费电话咨询、免费备件更换及免费现场支持服务,并提供原厂商授权合作伙伴的售后服务支持承诺函或不低于原厂技术水平的服务支持证明。
2、软件技术支持:提供1年7x24小时软件系统技术支持服务,包括集群系统搭建、集成、性能调优以及协助用户安装、调试、编译主流应用软件等。
3、系统和培训服务:提供每季度巡检,定期更新管理员手册和用户手册定期针对集群使用中遇到的问题进行远程培训和原厂相关专家现场交流。
且投标人必须协助采购人完成但不仅限于以下软件及其衍生版本的安装与调试,清单如下:
Annovar
apache-ant
BAMStats
bamtools
bcl2fastq
bedtools
bedtools2
binaries
blasr
blast
blat
blue
boost
bowtie
Burrows-Wheeler Aligner
Circos
clustal omega
clustalw
Cluster
cmake
Config-General
COPE
cpat
cramtools
cufflinks
cutadapt
Cytoscape
eigenstrat
Emboss
fastq_screen
fastQC
FASTX
fastx_toolkit
FLASH
Genome Analysis Toolkit(GATK)
HISAT
HMMER
Homer
htseq
IgBLAST
IGVTools
JAVA
MACS
MACS2
MAFFT
MATLAB
miRDeep2
MISO
MUSCLE
mySQL server
ncbi-blast
omixion
PAML
pandaseq
pca
PeakSplitter
PEAR
Penncnv
perl
PHP
PHYLIP
picard
Picard-tools
pindel
pip
Plink
Python
R
RepeatMasker
rMATS
rmblastn
RNA-SeQC
RSEM
Rstudio (server)
Rsync server
samtools
SeqPrep
SGA-assemble
SOAPdenovo
SOAPdenovo2
SOAPsnp
STAR-STAR
StringTie
TopHat
Trim_galore
Trimmomatic
trinity
trinityrnaseq
triplexator
Varid
VCFtools
ViennaRNA
Wise2
impute2
haploviewer
五、有关事项
(一)本信息自发布之日起5个工作日止,挂网期止后我院将根据情况通知报名单位前来推介洽谈。
(二)从信息发布之日起至挂网期止,有资质的企业均可报名。报名单位请将本信息发布中涉及的有关资料,上门递交或速递至“湛江中心人民医院信息科”。地址:广东省湛江市赤坎区源珠路236号。邮编:524045。电话:(工作日)0759—3157495、3157271(上午8:00-12:00,下午14:30-17:30) 联系人:黄工 18218794895
(三)本次市场调研并非正式采购行为,各公司所提供的相关信息仅有助于采购单位对该项目的认知。正式采购程序将依照《中华人民共和国政府采购法》以及广东省人民政府、湛江市人民政府及本单位的相关规定办理。
(四)报名单位须对其所提供的资料的真实性负责,如有作假,一经发现,立即取消资格,在二年内禁止参与我单位的所有项目邀请。

六、报名资料及条件
(一)产品(服务)方面
1、产品报价清单并加盖公章。
2、产品相关资料,性能特点介绍及使用说明等相关材料。
3、产品售后服务承诺。
4. 产品的生产厂商的资质认证: 1、ISO9001质量管理体系认证证书; 2、ISO27001信息安全管理体系认证证书;3、ISO20000信息技术服务管理体系认证证书;4、省(直辖市)级或以上高新技术企业证书;5、软件评测中心颁发的软件企业证书。
5.产品相关授权证书。
6、近三年内在广东省内三甲医院的用户名单及成交价格,需提供合同复印件。
7、联系人的姓名、职务、电话。
(二)企业资质方面
1、企业营业执照、税务登记证、组织机构代码证(以上资料复印件加盖公章)(若报价人已办理三证合一,则只需提供营业执照)。
2、法人授权委托书(原件加盖公章及法人代表印章或签名)。
3、产品销售授权书复印件加盖公章。

 

 

信息科
2024年12月3日

 

 

 

 

 

 

地址:广东省湛江市赤坎区源珠路236号(南门)、广东省湛江市赤坎区康宁路(北门)

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